Во 2 сезоне сериала «ФБР: Самые разыскиваемые преступники» Джесс Лакруа и его подчиненные из оперативной группы продолжают поиски преступников, представляющих наибольшую угрозу для безопасности страны. К таким относятся серийные убийцы, хакеры, а также террористы. Джессу и его коллегам предстоит поймать группу ополченцев, которые ответственны за убийство подростков, найти Трэвиса Рассела, уже находящегося под следствием, а также задержать людей, которые напали на давнего армейского приятеля Кросби.